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8 years developing Bioinformatics apps

The SING research group has been developed many Bioinformatics applications since the last 8 years. Here you can find a timeline summarizing some of the most successful ones!

 
Android: cocina con fundamento

Florentino Fernández-Riverola, líder del grupo SING, impartirá una conferencia titulada "Android: cocina con fundamento", el jueves 12 de marzo a las 17:00 en el Salón de Grados de la Escuela de Ingeniería Informática de Ourense.

Los objetivos de esta charla son:

  • Conocer las bases de la organización de los sistemas Android: ficheros importantes, particiones, la máquina virtual Dalvik, etc.
  • Aplicarlas en el rooteo de terminales o la elaboración de custom ROMS.

 
Aplicaciones prácticas de la inteligencia artificial en el ámbito sanitario: ¿acabaremos sustituyendo al clínico?

El Dr. Florentino Fernández-Riverola, líder del grupo SING, ha sido invitado por parte de la Academia Médico Quirúrgica de Ourense para participar el próximo 26 de febrero de 2015 en su ciclo de conferencias para el curso académico 2014-2015.

En esta ponencia que lleva como título Aplicaciones prácticas de la inteligencia artificial en el ámbito sanitario: ¿acabaremos sustituyendo al clínico?, Florentino realizará una breve introducción a todos los conceptos relacionados con la unión entre Medicina e Informática, la cual ha dado lugar a lo que se conoce como Informática Médica (Health Informatics), la cual envuelve cinco áreas de actuación fundamentales: (i) Consumer Health Informatics, (ii) Publich Health Informatics, (iii) Clinical Informatics, (iv) Clinical Research Informatics y (v) Translational Bioinformatics. En las tres últimas áreas, una pieza clave es la aplicación de técnicas y métodos de IA que tienen como objetivo final la generación de nuevo conocimiento relevante y la mejora global del proceso asistencial.

Además, también presentará distintos casos de éxito de sistemas inteligentes desarrollados por el grupo SING en el ámbito de la informática clínica, informática para la investigación clínica y bioinformática traslacional (de carácter genómico y proteómico). Todos estos sistemas han sido diseñados e implementados en estrecha colaboración con el personal sanitario, lo que ha garantizado un alto grado de utilidad para el paciente y ha sido clave en el éxito final.

 
Ingeniería Informática, la carrera con mayor tasa de colocación del Campus de Ourense

Según los datos publicados en el informe del Ministerio de Educación sobre el sistema Universitario Español y referente al curso 2013-2014, Ingeniería Informática se sitúa como la carrera del Campus de Ourense con mayor tasa de colocación.

Esta noticia viene a refrendar de manera oficial los resultados del informe realizado hace unos meses por el colegio profesional de ingeniería informática de Galicia, el cual situaba en el 90 % la tasa de colocación de estos graduados. Asimismo, José Ramón Méndez Reboredo, coordinador del Máster en Ingeniería Informática que se imparte en la ESEI (Escuela Superior de Ingeniería Informática), también declaraba que “Más del 90% de las personas que terminan los estudios encuentran trabajo a tiempo completo a los tres meses”.

Todas estas noticias reflejan la importancia de la carrera de Ingeniería Informática para el Campus de Ourense y el buen funcionamiento de la misma. Además, la buena salud de la que gozan esta titulación y la ESEI se vuelve a poner de manifiesto en que uno de los premios extraordinarios de fin de carrera de la Xunta de Galicia de este año es, nuevamente, un alumno de la escuela.

 
InNoCBR, referenced as "Good Practice" by Fenin

InNoCBR, the Hospital Acquired Infection intelligent surveillance system, developed by SING in collaboration with the University Hospital Complex in Ourense, has been published as a "Good Practice" in the book of the Fenin (Health Technology Companies Foundation).

For more information, you can visit the Fenin webpage.

 
BIOCAPS annual report 2013

The BIOmedical CAPacities Support program (BIOCAPS), where the SING group participates, has just published the BIOCAPS annual report 2013 (which can be downloaded here). This report is an annual book comprising a summary of the research areas, researchers involved and activities developed during the first year of the project.


Relevant contributions of the SING group to the BIOCAPS project in 2013 can be found in the section entitled New tools in diagnosis and therapy (pp. 23-25). Here, our research group contributes with several papers, one theses and two developed projects.

 
jARVEST (Java web harvesting library)

jARVEST (Java web harvesting library) is a simple web harvesting or web scraping framework. jARVEST is implemented via a powerful JRuby-based domain specific language (DSL), allowing you to develop harvesters with minimum code

 
Mass-Up

Mass-up is an open-source mass spectrometry utility for proteomics designed to support the preprocessing and analysis of MALDI-TOF mass spectrometry data.
Mass-up loads data from mzML, mzXML and CSV files and includes the following preprocessing tasks: baseline correction, normalization, smoothing, peak detection and peak matching.
In addition, Mass-up allows the user to perform the following analyses:

  • Quality Control
  • Biomarker discovery
  • Principal Component Analysis
  • Hierarchical clustering
  • Biclustering
  • Classification analysis

 

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2015 Sistemas Informáticos de Nueva Generación